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        鼠隱孢子蟲感染后小鼠腸道菌群變化及代謝組學研究
         
             論文目錄
         
        致謝第5-10頁
        摘要第10-12頁
        第一部分 文獻綜述第12-24頁
            1 隱孢子蟲和鼠隱孢子蟲第12-15頁
                1.1 隱孢子蟲第12-14頁
                    1.1.1 種屬第12頁
                    1.1.2 形態大小和寄生部位第12頁
                    1.1.3 生活史第12-14頁
                    1.1.4 隱孢子蟲的致病性第14頁
                1.2 鼠隱孢子蟲簡介第14-15頁
                    1.2.1 鼠隱孢子蟲第14頁
                    1.2.2 鼠隱孢子蟲流行病學第14-15頁
                    1.2.3 鼠孢隱孢子蟲分子鑒定第15頁
                    1.2.4 鼠隱孢子蟲的生物學分析第15頁
            2 小鼠腸道菌群研究進展第15-19頁
                2.1 小鼠腸道菌群的影響因素第16-17頁
                    2.1.1 飲食方面第16頁
                    2.1.2 藥物方面第16頁
                    2.1.3 微生物及其分泌因子方面第16-17頁
                    2.1.4 疾病方面第17頁
                    2.1.5 寄生蟲方面第17頁
                2.2 腸道菌群研究方法第17-18頁
                    2.2.1. 傳統的純培養法第17頁
                    2.2.2 ERIC-PCR分子雜交技術第17-18頁
                    2.2.3. 基于16S rDNA的分子測序技術第18頁
                    2.2.4. 熒光原位雜交技術第18頁
                    2.2.5. 宏基因組學研究方法第18頁
                2.3 16S rRNA測序技術在腸道菌群研究中的應用第18-19頁
                2.4 腸道菌群對機體的益處第19頁
                    2.4.1 益生菌對機體免疫的作用第19頁
                    2.4.2 腸道菌群對機體健康的作用第19頁
            3 代謝組學研究進展第19-21頁
                3.1 代謝組學的主要分析方法第20頁
                    3.1.1 核磁共振第20頁
                    3.1.2 液相色譜-質譜聯用第20頁
                    3.1.3 氣相色譜-質譜聯用第20頁
                3.2 代謝組學試驗的主要分析策略第20-21頁
                    3.2.1 非靶向代謝組學第20-21頁
                    3.2.2 靶向代謝組學第21頁
                3.3 小鼠代謝組學研究現狀第21頁
                    3.3.1 發病機制方面第21頁
                    3.3.2 藥物治療方面第21頁
            4 展望第21-24頁
        第二部分 鼠隱孢子蟲感染小鼠的部分生物學特征研究第24-32頁
            1 引言第24頁
            2 材料與方法第24-26頁
                2.1 卵囊來源第24頁
                2.2 試驗儀器和試劑第24-25頁
                    2.2.1 儀器第24頁
                    2.2.2 主要試劑和耗材第24-25頁
                2.3 方法第25-26頁
                    2.3.1 純化鼠隱孢子蟲卵囊并感染小鼠第25頁
                    2.3.2 OPG(Oocyst pergram)計數第25-26頁
                    2.3.3 制作組織病理切片第26頁
                    2.3.4 制作組織掃描電鏡切片第26頁
            3 結果與分析第26-30頁
                3.1 鼠隱孢子純化結果第26-27頁
                3.2 鼠隱孢子感染小鼠后OPG變化第27-28頁
                3.3 病理切片觀察第28-29頁
                3.4 組織樣品的掃描電鏡觀察第29-30頁
            4 結論與討論第30-32頁
        第三部分 鼠隱孢子蟲感染小鼠的腸道菌群變化研究第32-50頁
            1 引言第32頁
            2 材料與方法第32-34頁
                2.1 卵囊來源第32頁
                2.2 試驗儀器和試劑第32頁
                    2.2.1 儀器第32頁
                    2.2.2 主要試劑耗材第32頁
                2.3 方法第32-34頁
                    2.3.1 鼠隱孢子蟲感染小鼠和糞便樣品收集第32-33頁
                    2.3.2 糞便DNA提取第33頁
                    2.3.3 生物信息分析第33-34頁
                    2.3.4 生物信息學分析軟件第34頁
            3 結果與分析第34-46頁
                3.1 OTU累計曲線第34-35頁
                3.2 OTU Venn圖第35-36頁
                3.3 OTU PLS-DA分析第36-37頁
                3.4 物種組成分析第37-40頁
                    3.4.1 門水平物種相對豐度分析第37-38頁
                    3.4.2 科水平物種相對豐度分析第38-39頁
                    3.4.3 屬水平物種相對豐度分析第39-40頁
                3.5 物種PCA分析第40頁
                3.6 多樣性分析第40-45頁
                3.7 樣品間物種組成聚類分析第45-46頁
            4 結論與討論第46-50頁
        第四部分 鼠隱孢子蟲感染小鼠的代謝組學研究第50-78頁
            1 引言第50頁
            2 材料與方法第50-52頁
                2.1 卵囊來源第50頁
                2.2 試驗儀器和試劑第50-51頁
                    2.2.1 儀器第50頁
                    2.2.2 主要試劑耗材第50-51頁
                2.3 方法第51-52頁
                    2.3.1 鼠隱孢子蟲感染小鼠和糞便樣品收集第51頁
                    2.3.2 樣品處理和代謝物提取第51頁
                    2.3.3 樣品檢測和數據處理第51-52頁
            3 結果與分析第52-73頁
                3.1 數據質控第52-55頁
                    3.1.1 QC樣本的色譜圖重疊第52-53頁
                    3.1.2 所有樣本的主成分分析(PCA)第53-54頁
                    3.1.3 化合物數量和峰面積差異第54-55頁
                3.2 化合物檢測結果和注釋第55-59頁
                    3.2.1 化合物的檢測和鑒定情況第56頁
                    3.2.2 代謝物的分類和功能注釋第56-59頁
                3.3 統計分析及差異代謝物的篩選第59-62頁
                    3.3.1 主成分分析(PCA)第59-61頁
                    3.3.2 差異代謝物的篩選結果第61頁
                    3.3.3 代謝差異物分析第61-62頁
                3.4 差異代謝物分析第62-73頁
                    3.4.1 差異代謝物的聚類分析第62-67頁
                    3.4.2 差異代謝物的代謝通路富集分析第67-73頁
            4 結論與討論第73-78頁
        第五部分 結論和創新點第78-80頁
            結論第78-79頁
            創新點第79-80頁
        參考文獻第80-88頁
        ABSTRACT第88-90頁

         
         
        論文編號BS4734434,這篇論文共90
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